本中心在高教深耕特色中心計劃支援下，已建構了腫瘤免疫研究關鍵技術，並培養專職人員負責技術研發及操作下列技術平台：
- 基因體技術平台：
- (1)單細胞等級的四維解析能力：因腫瘤及免疫細胞皆具備高度異質性與複雜交互作用，微環境中不同細胞種類、時序及空間位置皆有重要意義，深層的調控網路是過去均質化研究方法所無法解析，高通量、高解析度的先進分析平台是探索複雜網絡的關鍵技術。本中心於高教深耕計畫支持下，建置「多光譜組織影像定量分析系統」、「空間轉錄體分析平台」及「單細胞轉錄體分析平台」等多項基因表現分析工具，提供探討腫瘤微環境中免疫細胞與癌細胞的交互作用的基因調解機制不可或缺的高效解析工具。
- (2)高效率的基因編輯核心：本中心於2017年起設立基因編輯核心，導入不需藥物篩選的雙螢光系統（CRISPR/Cas9 D10A system），簡單快速得到基因體編輯的細胞株，編輯核心提供中心基因功能研究的快速驗證工具。
- 生物資訊平台：因應基因體定序及影像技術產出巨量數據，其複雜度超出常規數值工具的負荷成為研究主要瓶頸，本中心結合國家高速網路及計算中心高速計算主機及本中心生物資訊分析專家，組建核心團隊，協助中心研究人員進行數據的管理與分析。
- 影像分析平台：2018年中心建立生醫光電平台及影像分析平台，提供腫瘤細胞移動即時影像分析及快速定量，並能分析細胞黏彈性、牽引力、核硬度和三維侵襲能力，以及細胞黏著斑蛋白和核纖層蛋白等分子層次蛋白表現及位置分布，提供細胞遷移及循環腫瘤細胞、癌細胞移動時細胞骨架重組的研究工具。
- 實驗動物平台：本中心引進建置各式先天免疫細胞系之條件式基因剔除鼠、分析抗原專一性之細胞株及基因轉殖鼠等等，提供先天免疫細胞研究所需實驗動物模型。2022年6月本中心在國科會生技醫藥核心設施平台計畫經費支持下，添購13,200,000元高階生物光子暨X射線擷取設備(PE IVIS)作為小鼠活體影像分析工具，完整建置腫瘤免疫學動物實驗的環境需求。
- 臨床資源平台：本中心有多位成員是台北榮總臨床醫師，透過團隊醫師個案收集、台北榮總人體生物資料庫以及健康大數據計畫累積，有系統累積臨床數據及檢體，成為重要的研究資源。本中心主要成員楊慕華教授、邱士華教授皆為臺北榮總執行國科會「精準大健康計畫」中「建置非小細胞肺癌與頭頸癌之轉譯導向巨量生醫資料」(計畫編號：MOST 110-2312-B-002-003、MOST 111-2321-B-075-003)之主要負責人，計畫於2021年5月1日通過執行至2022年底止已收案達387例，並且在臺北榮總人體試驗委員會同意之下，由本中心核心設施生物資訊團隊進行大數據分析。