國立陽明交通大學(以下簡稱本校)基因體中心創立於2000年，是國內最早創立的基因體研究中心。2017年之前執行「邁向頂尖大學計畫」，中心分為兩部分：
第一個部分是技術核心，由技術助理組成，並由兩位資深人員負責管理，除提供各種基因體技術服務之外，並負責發展新基因體技術平台、人才培育、教育訓練課程及基因體研究推廣等任務；第二部分為研究群組，由中心內部研究員、陽明交通大學教師，以及臺北榮總臨床醫師所組成，針對以疾病為導向之議題進行整合性之基因體研究，並定期召開研討會。中心的成果可分為兩大方向，一是尖端基因體技術的成果，一是基因體研究團隊的尖端科學發現。
成立時程及歷史沿革：
- 國立陽明交通大學腫瘤惡化卓越研究中心之前身為「榮陽基因體研究中心」，創立於2000年，是國內最早創立的基因體研究中心。
- 2015年與本校「免疫學中心」合併，針對國人具特色之重要癌症組成團隊進行重點研究。
- 2017年增加基因編輯技術核心（基因編輯核心），支援榮陽團隊研究。中心基因體設施核心（基因組核心）部分為科技部所支持的國家核心設施，由專職技術及研究人員（6人）提供校內外各種基因體技術服務，生物資訊分析，人才培育，教育訓練課程及基因體研究推廣等任務。
- 2018年獲得教育部高教深耕計畫五年研究支持，且同時更改中心名稱為「腫瘤惡化卓越研究中心」。
